La presenza di un edificio così grande e solenne in un borgo scarsamente abitato anche nei secoli passati è comprensibile solo se lo si individua quale luogo di culto da tempo immemorabile, al crocevia di sentieri che conducevano agli alpeggi: l’ipotesi è avvalorata dal ritrovamento di manufatti in pietra, incisioni rupestri e cavità scavate nella roccia, segni di antichissimi riti.
Il Santuario fu costruito  tra il 1771-1778, ma sicuramente preesisteva una cappella a sua volta sovrapposta a un pilone votivo.
In stile barocco si caratterizza per l’elegante facciata con quattro lesene disposte su tre ordini e con in cima un piccolo campanile centrale. La struttura dell’imponente facciata è alleggerita da una gande finestra ovale posta al centro e da delle nicchie che ospitano mosaici e due recenti statue.
Gli affreschi interni sono dei primi anni dell’Ottocento e raffigurano scene tratte dai Vangeli; sulle vele della volta sono rappresentati a grandezza naturale i quattro Evangelisti; le pareti sono tappezzate da più di duecento ex-voto, specchio di una religiosità legata alla vita di tutti i giorni: realizzati con le più svariate tecniche (dipinti su metallo, su tela e su tavolette di legno) o costituiti da cuori in argento, stampe e oleografie, rappresentano una notevole testimonianza storica e sociale della vallata.
Non esistono altari o cappella laterali ma solo alcuni confessionali e un pulpito.

Il santuario di Marsaglia è aperto la domenica da maggio ad ottobre. Le festività ricorrono il 15 agosto, con una suggestiva fiaccolata la sera precedente, e l’8 settembre.